Ciprofloxacin mempunyai penggunaan klinikal yang lebih luas daripada norfloxacin. Selain infeksi saluran kencing, jangkitan usus, gonorea, dan sebagainya, ia juga boleh digunakan untuk merawat bakteria influenza, E. coli, pneumoniae, Proteus mirabilis, Proteus biasa, Infeksi tulang dan sendi, kulit dan infeksi tisu lembut dan radang paru-paru, sepsis, dsb. yang disebabkan oleh Profidens, M. bacillus, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, C. fraudis, Staphylococcus (termasuk strain resistant methicillin), dan lain-lain. Penyediaan lisan produk ini serasi dengan norfloxacin; Pentadbiran intravena boleh digunakan untuk rawatan jangkitan teruk, seperti septik bakterium enterobacteriaceae, jangkitan paru, rongga perut, jangkitan saluran bilier dan sebagainya.
